Reviżjoni tas-Sena tal-MDJ: "Ġenotipazzjoni Profonda" - X'jista' jgħallimna s-sekwenzar tat-tielet ġenerazzjoni

It-titlu tal-artiklu huwa, Esplorazzjoni ta' Mard Newroġenerattiv bl-Użu ta' Sekwenzar b'Qari Twil u Teknoloġiji ta' Mmappjar tal-Ġenoma Ottiku. Prosit lit-tnejn li intom għal din in-nomina importanti. Dr. Cogan, għidilna ftit dwar l-isfond tiegħek u x'ispirak biex tikteb dan id-dokument.

Dr. Guillaume Cogan: Bongu. Grazzi talli stedintuna. Jiena ġenetista medika u issa [00:01:00] qed nagħmel dottorat fl-Istitut tal-Moħħ ta' Pariġi. U kellna proġett flimkien mill-Istitut tal-Moħħ ta' Pariġi mal-Istituti Nazzjonali tas-Saħħa, mal-kollegi tagħna li huma wkoll ko-awturi tal-karta, Kensuke Daida, Cornelis Blauwendraat, u Kimberly Billingsley.

Mela bażikament kellna grupp ta’ każijiet ta’ PD mhux solvuti, li kellhom sekwenzar tal-eżoma tad-demm. U kellna każijiet familjari u wkoll każijiet ta’ bidu bikri u ridna nippruvaw nidentifikaw xi ħaġa bħall-mutazzjoni li qed tikkawża l-marda. U biex nagħmlu dan, użajna sekwenzar b’qari twil. Se nidħol fid-dettalji ta’ dan fil-futur. U kellna każ interessanti, ridna nirrappurtaw dan dwar disturbi tal-moviment, u għalhekk għamilna. L-editur talabna nagħmlu reviżjoni dwar is-sekwenzar b’qari twil, iżda wkoll dwar l-immappjar ottiku tal-ġenoma biex niksbu reviżjoni tat-teknoloġiji l-ġodda li nistgħu nużaw f’disturbi newrodeġenerattivi.

Dr. Sarah Camargos: Sabiħ ħafna. Naħseb li l-ġenetika, xi kultant tista' tħossha bħala suġġett ta' sfida għan-newroloġisti [00:02:00]. Mela ejja nieħdu pass lura u nibdew bil-bażiċi. Se nitkellmu dwar it-tip ta' varjanti li jikkawżaw mard newrodeġenerattiv, varjanti ta' nukleotide wieħed, varjanti strutturali, u espansjonijiet ripetuti.

Tista' jekk jogħġbok tispjega dawn it-tekniki użati biex jiġu studjati dawn it-tip ta' varjanti?

Il-Professur Alexis Brice: Iva, nista' nibda jien u Guillaume jlesti. Naħseb li dak li hu tassew importanti huwa l-fatt li s-sekwenzar b'qari twil ifisser li tista' tanalizza frammenti twal tad-DNA minflok ma jkollok xi ħaġa bħal 150 sa 300 par ta' bażijiet moqrija, għal kull framment ikollok xi ħaġa bħal għexieren ta' kilo bażijiet, u dan ibiddel ħafna.

Għax tista' tiskopri ħafna mir-riarranġamenti [00:03:00], li ma jinstabux bit-tekniki tas-soltu. U dan ifisser, pereżempju, meta jkun hemm inverżjoni fil-ġene tista' tara l-punti ta' junction. Tista' s-sekwenzar tagħhom. Tista' tiskopri aktar faċilment duplikazzjonijiet jew tħassir.

U dan huwa suġġett ukoll għal ħafna mard newrodeġenerattiv. Kif ukoll espansjonijiet ripetuti. Dawk żgħar jistgħu jinqabdu b'tekniki klassiċi, imma ladarba jaqbżu d-daqs ta' 300 par bażi, ma jistgħux. Allura b'sekwenzar ta' qari twil. Għal darb'oħra, tista' taqbad dan it-tip ta' varjanti.

Allura dawk huma l-aktar aspetti importanti. Imma hemm oħrajn. Tista', pereżempju, tiddistingwi individwi li għandhom żewġ varjanti f'ġene. Tista' tgħid jekk humiex cis jew trans. U għal mard reċessiv, [00:04:00] iridu jkunu trans jekk trid tiżgura ruħek li huma responsabbli għall-marda.

Jista' jkollok ukoll applikazzjonijiet għal ġeni u psewdoġeni meta jkunu omologi ħafna, is-sekwenzar ta' qari twil jippermetti mill-ġdid li l-ġene jiġi sekwenzat b'mod indipendenti. Allura dan huwa tassew il-bażiku u żgur nistgħu nipprovdu ftit eżempji jekk trid.

Dr. Sarah Camargos: Sabiħ ħafna. Speċjalment meta qrajt id-dokument tiegħek, sibt interessanti ħafna li tuża dawn l-eżempji biex turi l-vantaġġi tas-sekwenzar twil bħalma semmejt fil-psewdoġeni u l-fażijiet. Tista' jekk jogħġbok taqsam magħna l-istorja dwar l-aħwa u t-tewmin b'varjanti PRKN? 

Dr. Guillaume Cogan: Iva. Allura l-kollega tagħna mill-NIH, Kensuke Daida, l-ewwel kellu dawn iż-żewġ aħwa b'fenotip li kien kompatibbli mal-marda ta' Parkinson. [00:05:00] Allura l-aħwa kellhom bidu bikri, progressjoni bil-mod tal-marda u bl-użu naħseb li kien sekwenzar tal-eżomi. Allura sekwenzar ta' qari qasir.

Kellhom varjant patoġeniku ta' nukleotide wieħed iżda varjant wieħed biss, għalhekk mhux biżżejjed biex jispjega l-marda. U mbagħad użaw sekwenzar ta' qari twil u identifikaw inverżjoni fit-tieni allele, li qed tispjega l-marda. U l-inverżjoni kienet kbira ħafna. Hija bażi ta' seba' mega.

Allura dan jispjega għaliex ma qabduhx l-ewwel. U mbagħad mill-koorti tagħna. Kellna wkoll żewġ aħwa b'forma awtosomali reċessiva tal-marda kompatibbli ma' PRKN, għal darb'oħra, bil-fenotip. U l-ewwel użajna l-metodi konvenzjonali ta' sekwenzjar ta' amplifikazzjoni b'ħafna sondi ta' ligazzjoni, sekwenzjar immirat b'sekwenzjar tal-eżoma.

U kellna tħassir tal-eżoma erbgħa, iżda mutazzjoni waħda biss għal darb'oħra, allura dan ma kienx biżżejjed biex jispjega l-marda. Użajna, għal darb'oħra, sekwenzar bil-qari twil, u sibna dik xi ħaġa interessanti ħafna. Għalhekk fl-ewwel studju [00:06:00] kellna tħassir tal-eżoma tlieta u l-eżoma erbgħa, u fit-tieni miżjud kellna duplikazzjoni tal-eżoma tlieta.

Allura b'kollox għandna żewġ kopji tal-eżoma tlieta, li huwa normali, hux? Nispera li lkoll għandna żewġ kopji tal-eżoma tlieta hawn.

Nittama u din hija r-raġuni għaliex l-għodod l-oħra tas-sekwenzar ma setgħux jaraw dan. U ejja ngħidu biss, is-sekwenzar ta' qari twil seta' jidentifika dan.

U mbagħad Kensuke u l-kollegi tiegħu estendew dan l-istudju għal, naħseb li kien hemm 23 individwu b'varjant wieħed ta' PRKN u bidu bikri ta' PD, u kienu kapaċi jsolvu kwart tal-każijiet bl-użu ta' sekwenzar twil. Għalhekk din hija xi ħaġa li hija sinifikanti, naħseb. U n-newroloġisti jistgħu jaħsbu dwarha meta jkollhom pazjent b'mutazzjoni waħda fil-PRKN u fenotip li huwa kompatibbli.

Dr. Sarah Camargos: U ġejt iggwidat biss għall-fenotipazzjoni. Dan huwa interessanti ħafna. Allura int, ħaffert ftit biex tara jekk kienx hemm varjant strutturali li seta' jispjega l-ieħor fil-varjazzjoni trans [00:07:00].

Dan huwa korrett? 

Dr. Guillaume Cogan: Yeah.

Dr. Sarah Camargos: Tal-għaġeb. Minbarra l-iskoperta tal-ġeni l-ġodda, aspett interessanti ieħor li għandu jiġi esplorat huwa l-karatterizzazzjoni tal-espansjoni ripetuta.

Kif inhi rilevanti din il-karatterizzazzjoni għall-fehim tal-fenotip jew il-konsulenza ġenetika?

Il-Professur Alexis Brice: Naħseb li hemm mill-inqas żewġ aspetti għall-espansjonijiet tar-ripetizzjoni. L-ewwelnett, id-daqs u d-daqs xieraq huwa importanti ħafna għaliex ġeneralment ikun hemm limitu li 'l fuq minnu ripetizzjoni tista' tingħad li hija patoġenika. U dan ivarja ħafna skont id-disturbi. U għal xi wħud minnhom, irrid ngħid li l-limitu li jista' jkun ta' valur għadu mhux ikkontestat, iżda mill-inqas 'il fuq minn ċertu valur, int ċert li huwa patoġeniku.

Għalhekk l-ewwel waħda hija d-daqs, li huwa assolutament [00:08:00] kruċjali għad-dijanjosi. U t-tieni aspett huwa s-sekwenza tar-ripetizzjoni. Għax jirriżulta li f'xi loci mhux biss id-daqs, iżda wkoll il-kompożizzjoni tar-ripetizzjoni, hija importanti. U hemm kompożizzjoni alternattiva, li wħud minnhom huma patoġeniċi u oħrajn li huma tollerati tajjeb u mhumiex assoċjati mal-marda.

Bis-sekwenzar tal-qari twil, ikollok it-tnejn b'ġebla waħda. Għandek kemm id-daqs tar-ripetizzjoni kif ukoll il-kompożizzjoni, u għalhekk tista' tgħid jekk ir-ripetizzjoni hijiex patoġenika jew le. U dan huwa importanti ħafna għal ħafna mir-ripetizzjonijiet identifikati reċentement bħala FGF 14 jew RFC 1 pereżempju.

Dr. Guillaume Cogan: Iva, forsi nista' nagħti eżempji dwar dan. FGF 14 huwa eżempju tajjeb ħafna. Għalhekk huwa responsabbli għal [00:09:00] atassija spinocerebellari numru 27 B ġiet identifikata pjuttost reċentement u nafu li espansjonijiet ta' GAA li huma inqas minn 200, mhumiex patoġeniċi. Madankollu, meta r-ripetizzjoni tkun 'il fuq minn 300, nafu li hija patoġenika u nużaw sekwenzar ta' qari qasir għaliex id-daqs tal-framment tal-qari huwa madwar 150.

Ma nistgħux inkunu nafu xi ħaġa li hija itwal. Nistgħu ngħidu biss li hemm espansjoni 'l fuq minn 150, imma ma nistgħux ngħidu jekk hijiex 'il fuq minn 300 jew le. Għalhekk ma nistgħux ngħidu jekk hijiex patoġenika u neħtieġu teknoloġija oħra biex ngħidu dan. Imma bl-użu ta' sekwenzar ta' qari twil, nistgħu ngħidu b'mod aktar preċiż id-daqs tal-espansjoni u nistgħu ngħidu jekk l-espansjoni hijiex 'il fuq mil-limitu jew le.

Eżempju ieħor tal-importanza tal-motiv, huwa ġene responsabbli għas-sindromu magħruf sew, l-atassja ċerebellari, in-newropatija, l-areflessija vestibolari, jiġifieri l-CANVAS. U nafu li l-espansjonijiet twal ta' [00:10:00] AAAG, jiġifieri huma ħames nukleotidi. Mhumiex patoġeniċi. Madankollu, l-espansjonijiet tal-motiv AAGGG huma patoġeniċi u bl-użu ta' sekwenzar b'qari twil, għandna l-motiv sabiex inkunu nistgħu nkunu nafu jekk huwiex patoġeniku jew le.

U naħseb li xi ħaġa importanti wkoll hija l-preżenza jew l-assenza ta' interruzzjonijiet. U niddiskutu dan fid-dokument. Għalhekk naħseb li eżempju tajjeb huwa l-atassja spinoċerebellari tnejn. Allura hija espansjoni CAG. U jekk f'din l-espansjoni tas-CAG, ikollna interruzzjoni jew diversi interruzzjonijiet tas-CAA minflok is-CAG, nafu li hija responsabbli mhux għall-atassja spinoċerebellari iżda għall-marda ta' Parkinson.

Il-motiv huwa l-preżenza jew l-assenza ta' integrazzjoni hija importanti. Għall-fenotip, iżda wkoll għall-età tal-bidu, il-penetranza, il-wirt tal-marda u s-severità u t-tip ta' fenotip. 

Il-Professur Alexis Brice: Għalhekk żgur nistgħu nistennew li [00:11:00] nidentifikaw aktar minn dawn ir-ripetizzjonijiet fil-futur. U nafu li fid-disturbi newroloġiċi dawn huma partikolarment frekwenti.

Għalhekk naħseb li, billi nissekwenzaw ħafna aktar każijiet, żgur li se niskopru mutazzjonijiet mhux magħrufa fil-futur.

Dr. Sarah Camargos: U stajt tiċċekkja wkoll il-metilazzjoni. Tista' tifhem ftit aktar dwar l-espressjoni tal-ġeni.

Dr. Guillaume Cogan: Assolutament bl-użu tal-metodi ewlenin tas-sekwenzar tal-qari twil. Nistgħu nidentifikaw il-metilazzjoni, u dan naturalment għandu diversi implikazzjonijiet fil-mard għaliex ġeneralment mhux dejjem ikun il-każ. Iżda ġeneralment elementi ipermetilati fid-DNA jkollhom inqas espressjoni meta mqabbla mal-ipometilazzjoni.

U fil-kuntest ta' disturbi newrodeġenerattivi. Naħseb li dan huwa interessanti. Pereżempju, jekk għandna l-ġene. Għadna kemm studjajna dan għal NOTCH2NLC, li huwa responsabbli għal meta [00:12:00] ikollok espansjoni GGGC fir-reġjun tal-ħames pre-materjali. Huwa responsabbli għal marda msejħa Neuronal Intranuclear Hyaline Inclusion Disease, u sabu li huwa interessanti ħafna, ġenituri mhux affettwati ta' tfal affettwati minn din il-marda kellhom espansjonijiet itwal meta mqabbla man-nisel. Allura mhux mistenni, hux? Imma bl-użu ta' sekwenzar ta' qari twil xorta waħda, sabu li din l-espansjoni GGC fil-ġenituri kienet ipermetilata. Allura l-ġene kien inqas espress meta mqabbel mal-espansjoni aktar baxxa. U din l-espansjoni hija patoġenika għaliex qed twassal għal RNA 4C li twassal għal sekwestrazzjoni ta' proteini li jorbtu l-RNA.

Mela bażikament jekk għandek espressjoni aktar baxxa, għandek inqas RNA 4C u allura ma jkollokx il-marda. Huwa interessanti ħafna li tara li l-metilazzjoni tippermettilna nifhmu għaliex xi mutazzjonijiet mhumiex patoġeniċi meta mqabbla ma' oħrajn.

Dr. Sarah Camargos: Tal-għaġeb. Interessanti ħafna. [00:13:00] Ejja nitkellmu ftit dwar l-immirar fis-sekwenzar tal-qari twil. F'April 2024, intervistajna lill-Prof. Houlden u lid-Dr. Zhongbo Chen bl-użu ta' sekwenzar tal-qari twil immirat biex jiddeskrivu l-SCA4. Tista' tfakkarna kif jaħdem dan il-metodu u jekk hemmx metodoloġija oħra għall-immirar minflok is-sekwenzar ta' kollox.

Dr. Guillaume Cogan: Iva. Allura hija mistoqsija tajba għax tista' tuża s-sekwenzar tal-qari twil f'diversi aspetti. Allura tista' tagħmel sekwenzar tal-ġenoma sħiħ imma tista' wkoll tagħmel sekwenzar immirat. U ngħid li hemm, fid-dokument nitkellmu dwar tliet metodi biex tagħmel dan. Allura l-ewwel tista' tuża l-metodu bbażat fuq Cas9.

Allura inti sempliċement taqbad ir-reġjun ta' interess billi tuża CRISPR Cas9, u mbagħad inti biss tissekwenza dan ir-reġjun ta' interess. Allura dan huwa l-ewwel wieħed. Ieħor huwa wkoll sempliċi. Huwa PCR fuq medda twila. Allura inti tamplifika r-reġjun ta' interess tiegħek billi tuża PCR fuq medda twila [00:14:00] flimkien. Imma ovvjament jekk tuża dan, jista' jkollok il-preġudizzju tal-amplifikazzjoni għax tuża reazzjoni katina tal-polimerażi, hux?

 Allura din hija t-tieni waħda, u l-aħħar waħda hija pprovduta biss minn Oxford Nanopore Technologies. Allura l-aħħar waħda hija kampjunar adattiv u hija pjuttost interessanti.

Mela bażikament għandek il-linja tad-DNA tiegħek, li tgħaddi mill-poru. U l-poru se janalizza l-ewwel mijiet ta' pari ta' bażijiet. Pereżempju, 400 par ta' bażijiet, u se jara jekk dawn il-pari ta' bażijiet humiex fir-reġjun ta' interess li għedt lill-magna tas-sekwenzar biex tissekwenza. Għalhekk, jekk tara li dan il-framment mhuwiex framment ta' interess, teħles mill-framment.

Għalhekk se jissekwenza biss it-triq kollha mill-frammenti tal-pori ta' interess. Allura dawk huma t-tliet metodi. Ibbażat fuq Cas9, PCR fuq medda twila, u kampjunar adattiv tal-ONT.

Dr. Sarah Camargos: Tajjeb ħafna. Professur Brice, għandi s-sensazzjoni li s-sekwenzar bil-qari twil huwa kważi bħall-verżjoni ġenetika [00:15:00] tal-fenotipazzjoni profonda, tip ta' ġenotipazzjoni profonda. Taqbel?

Il-Professur Alexis Brice: Naqbel għalkollox, bil-fenotipazzjoni profonda, issib affarijiet li ma rajtx għax ma fittixtx għalihom sew. U naħseb li dan huwa tassew importanti għan-newroloġisti li jkunu jistgħu jwettqu din il-fenotipazzjoni profonda, li tista' tgħin fid-dijanjosi. U hawn huwa eżattament l-istess għaliex l-għodod li użajna sas-sekwenzar tal-qari twil ma kinux kapaċi jiskopru xi wħud minn dawn il-varjanti.

U issa li għandna din l-għodda, nistgħu niskopru dawn il-varjanti u nistgħu ntejbu d-dijanjosi. Għalhekk huwa eżattament simili ħafna ħlief li l-ispiża tal-fenotipazzjoni profonda tista' tkun inqas minn sekwenzar b'qari twil fil-mument, għall-inqas.

Dr. Sarah Camargos: Iva. Meta nitkellmu dwar l-isfidi fir-rigward tas-sekwenzar tal-qari twil, x'inhuma l-isfidi l-kbar għalina [00:16:00]? Minbarra l-ispiża.

Dr. Guillaume Cogan: Lil hinn mill-ispiża, l-isfidi huma l-ewwel, il-laboratorju mxarrab. Għalhekk il-protokoll tal-laboratorju mxarrab għadu mhux standardizzat. Ukoll, il-pipeline bijoinformatiku biex tissejjaħ il-varjanza mhuwiex standardizzat. U wkoll għandek bżonn ħafna kapaċitajiet ta' ħażna tad-dejta għax jiġġenera mijiet ta' giga bażijiet.

Għalhekk teħtieġ kapaċitajiet ta' ħażna tajbin. Ukoll GPUs u CPUs tajbin biex isejħu l-varjanza huma intensivi ħafna fil-komputazzjoni u fl-aħħar tal-katina, ejja ngħidu biex tinterpreta l-varjanza, huwa wkoll aktar diffiċli għax għandna ħafna aktar varjanza. Tal-anqas aħna kunfidenti fil-varjanza tagħna għax, pereżempju, jekk tagħmel sekwenzar ta' qari qasir, tipprova tanalizza l-varjanza strutturali, taf li ħafna minnhom huma biss pożittivi foloz. Imma bl-użu ta' sekwenzar ta' qari twil, taf li ħafna minnhom huma pożittivi veri. Madankollu meta nanalizzaw il-varjanza, jekk trid tidentifika l-kawża tal-marda ta' pazjent, trid tneħħi l-varjanza li għandha frekwenza għolja [00:17:00] li hija komuni, proprju f'kull wieħed u waħda minna biss biex nagħżlu varjanti.

Il-ħaġa hi li għal żmien twil bis-sekwenzar, m'għandniex katalgi bħal Genome 80 għal sekwenzar ta' qari qasir. Għalhekk huwa diffiċli li tiffiltra l-varjanza ta' qari qasir. Madankollu, hemm xi proġetti kollaborattivi, pereżempju, il-proġett 1000 Genome li qed jissekwenza mijiet jekk mhux eluf ta' kontrolli b'saħħithom biex jipprovdilna databases tal-popolazzjoni, li jippermettulna niffurmaw il-varjanza skont il-frekwenza.

U, fl-aħħar, wara ftit esperjenza biha, xi kultant tkun frustranti għax tkun qisek, jien nissekwenza t-tipi kollha ta' varjanza li għandi bħala SNDs ta' varjanza strutturali, ripetizzjonijiet qosra ta' qari, imma ma nsibx il-mutazzjoni ġenetika. Imma naf li qiegħda xi mkien hawn, imma nista' nieħu eżempju wieħed biss.

Pereżempju, għandna varjanti strutturali introniċi li jistgħu jaffettwaw l-isplicing ta' ġene, iżda m'għandniex għodda biex inbassru jekk dan hux qed jaffettwa l-isplicing jew le. Għalhekk nittamaw li fil-futur il-bijoinformatiċi [00:18:00] jiżviluppaw dawk l-għodod sabiex inkunu nistgħu finalment nidentifikaw il-kawża tal-marda tan-nies kollha b'disturb ġenetiku, ejja ngħidu aħna.

Dr. Sarah Camargos: Jew saħansitra sekwenzaw l-RNA kollu wkoll.

Dr. Brice jew Cogan: Iva, din hija oħra. Bl-użu ta' sekwenzar twil. Iva, nistgħu nidentifikaw isoformi ġodda kif nitkellmu dwarhom fid-dokument.

Dr. Sarah Camargos: U wkoll fid-dokument tiegħek esplorajt il-possibbiltajiet tal-immappjar ottiku tal-ġenoma. Spjega kif taħdem din it-teknika u x'inhuma l-vantaġġi ewlenin.

Dr. Guillaume Cogan: Allura, huwa pjuttost differenti meta mqabbel mas-sekwenzar ta' qari twil għax mhuwiex sekwenzar. Bażikament inti sempliċement ittikketta d-DNA tiegħek f'xi sekwenza kanonika, sekwenzi qosra, u mbagħad għandek mikroskopju li jħares lejn id-distanza bejn it-tikketta ttikkettjata tad-DNA tiegħek. Allura b'dan tista' tidentifika varjanti strutturali li huma 'l fuq minn 500 par ta' bażijiet.

Allura ma tistax tara dak xejn taħt dak. Dik hija ħaġa waħda. Int [00:19:00] ma tistax tara wkoll SNDs, varjant ta' nukleotide wieħed bl-użu ta' mapping ottiku tal-ġenoma. Madankollu, huwa pjuttost interessanti għaliex il-fond, il-kopertura hija aħjar meta mqabbla mas-sekwenzar ta' qari twil. Tista' tikseb fond ta' kopertura ta' 150 bl-użu ta' OGM meta mqabbel mas-soltu ta' 20 sa 30 x bis-sekwenzar ta' qari twil.

U, u iva, dik hija l-ħaġa prinċipali tal-OGM ngħid jien. Allura xi nies qabblu l-OGM u s-sekwenzar bil-qari twil. U għas-sekwenzar bil-qari twil, huwa diffiċli li jiġu identifikati varjanti, varjanti strutturali li huma 'l fuq minn 50 kb. Madankollu, l-OGM huwa tajjeb biex jiġu identifikati dawk it-tip ta' mutazzjonijiet. Allura ngħid li jekk għandek flus, tista' tuża t-tnejn u dak ikun l-aħjar.

Imma għandek bżonn flus biex tagħmel dan 

Dr. Sarah Camargos: Dażgur.

Il-Professur Alexis Brice: Le, jiġifieri, għandek bżonn ukoll DNA b'piż molekulari għoli u dik xi kultant hija limitazzjoni għal dawn it-tekniki. U l-bijobankar klassiku xi kultant juża tekniki ta' estrazzjoni [00:20:00] li ma jipprovdux DNA bħal dan. Għalhekk hija xi ħaġa li trid tikkunsidra għall-inqas ukoll, għall-koorti jew kampjuni prospettivi li qed tikseb.

Dr. Guillaume Cogan: Iva. U xi ħaġa wkoll għall-OGM, naħseb li limitazzjoni tal-OGM li hija tajba li tkun taf għas-semmiegħa hija li huwa diffiċli ħafna li tikseb il-post preċiż tal-punti ta' ksur bl-użu tal-OGM. Normalment ma tistax tiksibha. Hija bejn 6 KB u 15 kb. Għalhekk tista' tkun importanti fil-ġenetika medika għaliex bl-użu tal-OGM, tista' tgħid li varjant strutturali qed jinkludi eżoma, filwaqt li mhux hekk, mhijiex pożittiva falza, iżda sempliċement mhix preċiża daqs is-sekwenzar ta' qari twil għall-varjanza strutturali.

Għalhekk għal darb'oħra, tajjeb li tuża t-tnejn jekk trid tuża OGM, iva.

Dr. Sarah Camargos: Allura tbassar li dawn iż-żewġ teknoloġiji se jsiru l-ewwel approċċ tas-sena biex jiġu djanjostikati disturbi newroġenerattivi ereditarji fil-futur? 

Il-Professur Alexis Brice: Sakemm il-[00:21:00] flus ikunu hemm biex iħallsu għalihom. Iva, naħseb li, dawn jippermettu b'mod ċar li tissolva proporzjon akbar ta' każijiet u għalhekk huma utli ħafna. Naħseb li jekk irridu li jkollna approċċ, approċċ tal-ewwel u l-aħħar livell fejn teknoloġija waħda tista' tipprovdi r-riżultati.

Dr. Guillaume Cogan: Iva, għad fadal triq twila biex dawn it-teknoloġiji jkunu l-ewwel li jintużaw hawn, ngħid jien. Iva.

Dr. Sarah Camargos: Iva. Tajjeb ħafna. Qabel ma nispiċċaw, hemm messaġġ ewlieni wieħed li t-tnejn li intom tixtiequ li s-semmiegħa tagħna jieħdu minn dan id-dokument?

Dr. Guillaume Cogan: Iva. Allura naħseb li trid tkun taf il-proġett tiegħek u verament x'tixtieq tara qabel ma tuża dawn it-teknoloġiji. U naħseb li fl-artiklu tagħna, għamilna l-almu tagħna biex nagħtu eżempji sabiex il-qarrej ikun jista' jifhem x'jista' jikseb minn dawn it-teknoloġiji. U naħseb li iva, il-qari ta' dan l-artiklu huwa mod kif tifhem aħjar dan u tużah b'mod [00:22:00] xieraq għal kull proġett ta' xi ħadd. Iva.

Dr. Sarah Camargos: Iva. Allura tobba nirringrazzjawkom ħafna talli ngħaqadtu magħna. U qsamtu l-għarfien tagħkom illum. Grazzi lis-semmiegħa kollha tagħna talli qegħdin magħna fuq il-Podcast tal-MDS. Ibqgħu magħna għall-episodju li jmiss tagħna, u sadanittant ħudu ħsiebkom u addiju.

Dr. Guillaume Cogan: Grazzi talli kellna.